Microbiota pulmonar en pacientes HIV - neumonía y su efecto en la función pulmonar: estudio de cohorte‚ Colombia.

Introducción. Se sabe poco sobre la microbiota pulmonar en pacientes con infección por VIH y neumonía y su efecto sobre la función pulmonar. Ma-teriales y métodos. Estudio de cohorte prospectivo en pacientes con neu-monía y/o infección por VIH en el año 2018 en tres instituciones de Medellín‚ Colombia. Se excluyeron los pacientes que recibieron antibióticos por más de 72 horas‚ inmunosupresión severa por otras causas y enfermedad pulmonar severa. Se recogieron datos clínicos‚ microbiológicos y espirométricos al inicio y a los seis meses de seguimiento. La microbiota se estudió en esputo indu-cido (EI) y lavado broncoalveolar (BAL) y se procesó mediante secuenciación de gen 16s rRNA en la plataforma Illumina MiSeq. Resultados. Se tamizaron 248 pacientes y se incluyeron 64 así: HIV+/neumonía+ (n= 27)‚ HIV+/ neumo-nía- (n= 30)‚ HIV-/neumonía+ (n= 7). El 70‚3% fueron hombres‚ 76‚6% tenía entre 25 y 64 años. Los microorganismos más frecuentes en el grupo HIV+/neumonía+ por métodos convencionales fueron: Mycobacterium tuberculosis(21‚9%)‚ Pneumocystis jirovecii (7‚8%)‚ y Streptococcus pneumoniae (4‚7%). La microbioma pulmonar difiere entre los grupos de estudio‚ al inicio y final del seguimiento‚ y entre las muestras de lavado broncoalveolar y esputo inducido.
El grupo HIV+/neumonía+ tuvo una tasa de función pulmonar más baja en comparación con el grupo VIH. Conclusiones. La microbiota pulmonar difiere entre los grupos de estudio‚ al inicio y a final del seguimiento‚ y entre las muestras de BAL y EI. En el grupo con HIV+/neumonía+ la función pulmonar se afectó al inicio y mejoró significativamente en los primeros meses después del episodio agudo por neumonía.